En 2016, le journaliste et producteur Del Bigtree lance un défi inédit au responsable des maladies infectieuses de Henry Ford Health : réaliser l’une des plus vastes études comparatives jamais menées entre des enfants vaccinés et non vaccinés, et en publier les résultats quels qu’ils soient. Des années plus tard, cette recherche, conduite à partir de milliers de dossiers médicaux au sein du système de santé Henry Ford, n’a jamais été publiée dans une revue scientifique ni rendue publique. Avec An Inconvenient Study, Del Bigtree revient sur cette enquête restée dans l’ombre et cherche à comprendre pourquoi ses conclusions n’ont jamais été diffusées. À travers des entretiens, des archives et des témoignages de médecins, chercheurs et responsables de santé publique, le film interroge les liens entre recherche médicale, transparence institutionnelle et débat public autour de la vaccination.